وان کدکس می خواهد جستجوی DNA را به آسانی جستجو در گوگل کند

چندین سال پیش، توالی یابی ژنوم انسان کار بسیار هزینه بر و سنگینی بود و مشخص کردن جایگاه ژن ها روی هر کروموزوم، هزاران دلار خرج بر می داشت اما در حال حاضر این پروسه به حد کافی مقرون به صرفه شده که متخصصین سلامت برای ارزیابی حال مریض شان می توانند به اندازه چند پتابایت توالی ژنوم را در دست داشته باشند اما استفاده از آن ها مسئله دیگری است.

الگوریتم فعلی جستجوی ژن BLAST نام دارد که به حد کافی هم سریع نیست اما یک شرکت قصد دارد الگوی جدیدی برای کنکاش در توالی ژن ها معرفی کند که «کدکس وان» نام دارد. این جستجوگر ژنتیکی به طور میانگین سرعتی 1500 برابری الگوریتم های قدیمی دارد.

این ابزار در حال حاضر فاز بتا را سپری می کند ولی نتایج اولیه بسیار امیدوارکننده بوده اند. برای مثال فرایند تشخیص یک توالی توسط BLAST تقریبا 2 دقیقه و 30 ثانیه به طول انجامید در حالی که همان داده در زمان یک بیستم ثانیه در وان کدکس پاسخ می دهند که این یعنی سیستم جدید در این مورد خاص 3 هزار برابر سریع تر عمل کرده. سرعت عمل بالاتر قطعا در آینده به کمک متخصصین بسیاری خواهد آمد که دنبال پاسخ های سریع می گردند.

نیک گرینفیلد (یکی از دو موسس پروژه)

نیک گرینفیلد (یکی از دو موسس پروژه)

به جای استفاده از تست های مخصوص برای توبرکلوزیس، دکترها نمونه هایی از بدن می گیرند، نمونه را توالی یابی کرده و آن اطلاعات زیستی را تبدیل به اطلاعات قابل بررسی می کنند. سپس به صورتی جامع، جستجوگر ویژگی های اصلی پاتوژن را به شما می گوید. ویژگی هایی مانند نوع باکتری، لایه های مقاومتی آن و به طور کلی بیان می کند که آیا شما ناقل هستید یا خیر.

مایکوباکتریوم توبرکلوسیز، نوعی باکتری است که باعث بیماری سل می شود و پاتوژن به طور کلی به ساختارهای بیماری زا از جمله برخی باکتری ها، ویروس ها و قارچ ها گفته می شود. به عنوان مثال توبرکلوسیز نوعی پاتوژن محسوب می شود. توالی یابی نیز به فرآیند یافتن جایگاه ژن روی کروموزوم گفته می شود. در حقیقت توالی یابی ژنوم یک بیماری مثل توبرکلوسیز، اطلاعاتی جامع از آن باکتری در اختیار متخصصین قرار می دهد تا راحت تر بتوانند با آن مبارزه کنند.

مسلما اطلاعات بالا اگر کارآمد باشند فوق العاده خواهند بود. در حال حاضر، دیتابیس این جستجوگر قابلیت شناسایی 30 هزار باکتری، ویروس و قارج را دارد که این رقم در حال افزایش است. البته وان کدکس احتمالا موتور جستجویی نیست که هر شخصی بخواهد از آن استفاده کند اما حداقل می توان در دراز مدت از اینکه چنین تکنولوژی ای وجود دارد خوشحال بود.

منبع:
Engadget ، Tech Crunch
برچسب ها

مطالب مرتبط

کشف بیش از 300 ویروس بزرگ با قابلیت های عجیب

محققان چندین ویروس عجیب از نقاط مختلف دنیا کشف کردند. آنها باکتریوفاژ (فاژ) یا همان ویروس هایی را کشف کرده اند که به باکتری ها حمله کرده و آنها را از بین می برند. این جانداران بسیار کوچک از نظر ابعاد، بسیار بزرگ تر از ویروس های معمولی بوده و توانایی ها پیچیده ای دارند... ادامه مطلب

صندوق سرمایه‌گذاری جسورانه فیروزه به صورت رسمی آغاز به کار خواهد کرد

گروه مالی فیروزه پس از فعالیت‌های مختلف در زمینه سرمایه‌گذاری، این بار با چشم‌اندازی روشن دیگری و در راستای تداوم سرمایه‌گذاری‌های آتی اقدام به تاسیس صندوق سرمایه‌گذاری جسورانه کرده است.در نشست خبری آغاز فعالیت رسمی صندوق سرمایه گذاری جسورانه فیروزه که صبح امروز (۱۶ بهمن ماه) برگزار شد، «رادمان ربیعی» معاونت سرمایه‌گذاری جسورانه گروه مالی فیروزه... ادامه مطلب

کشف گونه جدید کوسه راه رونده در اندونزی [تماشا کنید]

محققان چهار گونه کوسه جدید کشف کرده اند که به کمک باله های خود در کف دریا «راه» می روند. این شیوه حرکتی در کوسه ها بسیار نادر بوده و برتری بزرگی به این جاندار برای شکار طعمه های کوچک می دهد.محققان این گونه های خارق العاده را در آب های استوایی مجمع الجزایر هند-استرالیا... ادامه مطلب

محاسبه جذر اعداد با کامپیوتر ساخته شده از DNA

دانشمندان با استفاده از سیستم شبه رایانه‌ای ساخته شده از DNA مهندسی شده، موفق به انجام محاسبات ریاضی شدند.زیست شناسان از اوایل سال ۱۹۹۴ استفاده از مواد ژنتیکی برای انجام محاسبات را پیشنهاد کرده اند. از آن زمان راه هایی برای ذخیره داده در DNA و دستکاری آنها با منطق شبیه به 0 و 1 دنیای کامپیوتر... ادامه مطلب

ساماندهی تظاهرات گسترده علیه جف بزوس در ۳۰۰ شهر هند

مدیرعامل آمازون قرار است هفته آینده به «دهلی نو» سفر کند اما خرده فروش‌های هندی از همین حالا خود را برای برپایی تظاهرات علیه وی آماده کرده اند.کمپانی آمازون هفته آینده برای برقراری ارتباط با کسب و کارهای کوچک و متوسط هندی رویدادی را در پایتخت این کشور برگزار خواهد کرد. به گفته منابع مختلف... ادامه مطلب

AMD کارت گرافیک RX 5600 XT را معرفی کرد؛ تجربه گیمینگ 1080p با نرخ فریم بالا

AMD از پردازشگر گرافیکی RX 5600 XT رونمایی کرده که از نظر قدرت دقیقاً زیر RX 5700 قرار می گیرد و به این ترتیب در رده چیپ های گرافیکی پرچمدار به حساب نمی آید.RX 5700 یک پردازشگر با کارایی بالا برای اجرا در رزولوشن 1080p است. پردازشگر گرافیکی RX 5600 XT قرار است اجرای بازی ها با... ادامه مطلب

نظرات ۱۲

وارد شوید

برای گفتگو با کاربران، وارد حساب کاربری خود شوید.

ورود

رمزتان را گم کرده‌اید؟